Ο Γιάννης Ιωαννίδης είναι Πρόεδρος της Association for Computing Machinery (ACM). Επίσης είναι Καθηγητής στο Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του  Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών καθώς και συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ στο Ερευνητικό Κέντρο "Αθηνά" του οποίου διατέλεσε Πρόεδρος και Γενικός Διευθυντής για 10 χρόνια. Τα ερευνητικά ενδιαφέροντά του περιλαμβάνουν Βάσεις Δεδομένων και Πληροφοριακά Συστήματα, Επιστήμη δεδομένων, Αναλυτική Δεδομένων και Κειμένων, Κλιμακώσιμη Επεξεργασία Δεδομένων, Υποδομές Δεδομένων και Ψηφιακά Αποθετήρια,  και Εξατομίκευση και Συστήματα Συστάσεων, θέματα για τα οποία έχει δημοσιεύσει περισσότερα από 170 άρθρα σε κορυφαία περιοδικά και συνέδρια, ενώ κατέχει και τέσσερα διπλώματα ευρεσιτεχνίας. Το έργο του συχνά εμπνέεται από και εφαρμόζεται σε προβλήματα διαχείρισης και ανάλυσης δεδομένων που ανακύπτουν σε βιομηχανικά περιβάλλοντα ή στο πλαίσιο άλλων επιστημονικών πεδίων (Επιστήμες Ζωής, Φυσικές Επιστήμες, Βιοποικιλότητα, Πολιτιστική Κληρονομιά). Είναι συντονιστής των έργων και επικεφαλής του νομικού προσώπου OpenAIRE, το οποίο υλοποιεί τις ευρωπαϊκές πολιτικές για την ανοιχτή πρόσβαση σε ερευνητικές δημοσιεύσεις και ερευνητικά δεδομένα, ο διευθυντής λογισμικού στην εμβληματική πρωτοβουλία Human Brain Project και μέλος του συμβουλίου διαχείρισης της αντίστοιχης ερευνητικής υποδομής EBRAINS, ο συντονιστής του στρατηγικού έργου EOSC Future, το οποίο υλοποιεί τα βασικά τμήματα της υποδομής European Open Science Cloud, και συντονιστής ή εταίρος σε δεκάδες άλλα ευρωπαϊκά έργα έρευνας και καινοτομίας. Έχει επίσης ηγηθεί της δημιουργίας νέων διεθνών εταιρειών και τεχνοβλαστών (spin-off). Ο Γιάννης Ιωαννίδης είναι Fellow των επιστημονικών οργανώσεων ACM και IEEE, μέλος της Academia Europaea, και είναι κάτοχος του ACM SIGMOD Contributions Award και άλλων ερευνητικών και διδακτικών βραβείων. Έχει διατελέσει εθνικός εκπρόσωπος του Φόρουμ Ευρωπαϊκής Στρατηγικής για τις Ερευνητικές Υποδομές (ESFRI) για πάνω από 10 χρόνια, έχοντας υπηρετήσει και ως αντιπρόεδρος και μέλος του εκτελεστικού συμβουλίου του Φόρουμ για πολλά από αυτά, ενώ επί του παρόντος διατελεί συν-πρόεδρος του Παγκόσμιου Κόμβου για το Κλίμα του Δικτύου Λύσεων Βιώσιμης Ανάπτυξης του ΟΗΕ (UN Sustainable Development Solutions Network).